Стало известно, что дело, в рамках которого Семенов был задержан, связано с хищениями в ФГУП «ЗащитаИнфоТранс». Предварительная оценка суммы мошеннических действий превышает 200 миллионов рублей. В случае если вина Алексей Семенова будет установлена, ему может грозить до 10 лет тюремного заключения.
Алексей Семенов был назначен на должность заместителя министра транспорта по цифровому развитию в октябре 2018 года бывшим премьер-министром России Дмитрием Медведевым.
В ноябре 2020 года Алексей Семенов был освобожден от должности замминистра транспорта по его просьбе, которую удовлетворил глава правительства РФ Михаил Мишустин.
